Beim Kampf gegen Onimaru geht einiges kaputt bzw verloren und deswegen gibt's eine neue Mission, die Drachenkugel finden mithilfe einer Eule. Dabei haben sie durch Zufall noch eine Karte mit der man beweisen kann es gibt noch mehr legendäre Kugeln. Onimaru holt sich einen verrückten Wissenschaftler ins Team der ihm einige neue Waffen zusammen baut und andere Veränderungen am Schloss vornimmt. Man hat nun ein Drittel der Reihe geschafft, insgesamt soll es 24 geben.